雙雄反目
　　擊敗呂布、迎回獻帝之後，曹操趁隙擴張勢力，軍威大振，劉備仁義之名亦遠播四方。但曹操還有更遠大的目標。他打算將獻帝封印於神州中央的通天神柱，並從各方種族中挑選擁有火鳳之力的族裔進行犧牲祭獻，將其力量轉渡給獻帝，意圖以人為恢復火鳳之力，創建「永恆治世」。

　　劉備極力反對如此殘酷的計劃，終與曹操分道揚鑣、反目成仇，此時已經擁有龐大軍勢的曹操不容許劉備破壞大計，乃揮軍相向，劉備軍難以抗衡，兵敗如山倒。

　　危及之際，靜觀天下大勢的超級軍師「臥龍．諸葛亮」出山援救劉備，並協助劉備軍保護數十萬種族展開萬里逃命作戰。同期間，孫堅長子孫策本欲趁隙揮軍北上，卻意外遇伏身亡。孫吳二次失去宗主，統領孫吳全軍的重責大任落到了少年君主孫權的身上。

　　不久，「臥龍．諸葛亮」出使孫吳，與「火神．周瑜」連成一氣，曹操軍中的異類「仙魔同體．司馬懿」亦暗中斡旋，終於促成劉備、孫權共抗曹操霸權的局面，一場名留千古的史詩戰役「赤壁之戰」於是展開！ 
 
三國鼎立
　　赤壁一役，孫劉聯軍痛擊曹軍，曹軍三十萬水師付之一炬，從此確立了曹操、劉備、孫權三方鼎足並立。但此時的劉備與孫權已無餘力阻止曹操的永恆治世計畫。

　　曹操回到北方後，強迫數個種族進行血脈犧牲，擷取火鳳之力灌注於封印獻帝的通天神柱，平息了各地天災，使得永恆治世計畫得到初步的成功，因而受到眾多種族的擁戴。此後曹操以救世主之姿廣納各族能人，只看才能、不問出身，收編了異族五妖大將，構築史上最強大的異族軍團，以此消滅了西涼馬騰勢力，統一了整個北方，建立了崇文尚武的國家——魏國。

　　但劉備心中的大義仍未熄滅。他依然希望阻止曹操犧牲他人的惡行，決心為「保護眾生」起身奮戰。數年轉戰各地，劉備在魔龍仙鳳四奇人的幫助下入主益州，建立了以仁義為號召的國家——蜀國。此時的劉備手下能人輩出，五虎上將名動神州，形成魏蜀抗衡之勢。

　　而赤壁戰後的孫吳政權亦躍上了神州爭霸的舞台，歷經父子三人銳意經營，已擁有左右天下的實力。但孫吳不再堅持聯劉抗曹的策略，沒有人知道，繼承父兄遺志的少年君主孫權心中到底在想些什麼…… 　　是年，漢帝國建安二十年。三國征戰的歷史，才正要展開。